Skip to main content

Clinical MicrobiologyLaajuus (10 cr)

Code: SX00ED06

Credits

10 op

Objective

Learning outcomes
As a student you are able to describe the organisation of infection control in Finland and explain the legislation governing clinical microbiological laboratory activities. You can name the most common aerobic bacteria, their characteristics and the infectious diseases they cause. You can perform the most common clinical bacteriology tests and understand their principles. You are able to explain the diagnostic methods used for other microbes, such as viruses, fungi and parasites. You are able to collect high-quality clinical microbiological samples and to guide other health care personnel in taking microbiological samples. You assess pre-analytical, analytical and post-analytical factors related to clinical microbiology and are able to apply them in your work. You adhere to the principles of quality management. You know how to work safely and aseptically in a clinical microbiology laboratory.

Content

Contents
Infection epidemiology and organisation of infection control in Finland
Legislation governing communicable diseases and authorisation of microbiological laboratory activities
Microbes as the cause of diseases and the key infectious diseases they cause
Safe and aseptic work procedures
Collection, handling and transportation of clinical microbiological samples
The most common aerobic microbe groups; the structure, characteristics, multiplication and growth requirements of microbes
Antimicrobial drugs, their effect and resistance mechanisms, determination of sensitivity
Resistant bacteria
Analysis methods in bacterial genetics
Methods of analysing the most common parasites, identification of faecal parasites
cultivation of fungi on culture media, laboratory diagnostics of yeast and filamentous fungi
Antimycotic drug studies on yeasts
Virology, antibody tests, antigen detection methods, utilisation of fluorescence in test methods.
Use of the MALDI-TOF MS technique

Prerequisites

Prior competence
Anatomy, Physiology and Pathophysiology, Pre-analytics, Methods in Laboratory Work, Chemistry, Mathematics and Physics, Immunology, Cell Biology, Biochemistry and Basics of Medicine.

Assessment criteria, satisfactory (1)

Assessment criteria
0–5
Assessment framework, see the appendix.
Assessment criteria for advanced level are applied.

Enrollment

06.05.2024 - 19.05.2024

Timing

12.08.2024 - 20.12.2024

Number of ECTS credits allocated

10 op

Virtual portion

1 op

Mode of delivery

90 % Contact teaching, 10 % Distance learning

Unit

School of Rehabilitation and Examination

Campus

Myllypurontie 1

Teaching languages
  • Finnish
Degree programmes
  • Biomedical Laboratory Science
Teachers
  • Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman
  • Bioanalytiikka1 Virtuaali
Teacher in charge

Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman

Groups
  • SXJ22S1
    Bioanalytiikan tutkinto-ohjelma päivä

Objective

Opiskelijana osaat kuvata, miten infektioidenvastainen toiminta on organisoitu Suomessa ja miten lainsäädäntö ohjaa kliinisen mikrobiologian laboratoriotoimintaa. Osaat nimetä yleisimmät aerobimikrobit, niiden ominaisuudet sekä niiden aiheuttamat infektiotaudit. Osaat tehdä kliinisen bakteriologian yleisempiä tutkimuksia ja ymmärtää niiden periaatteita. Osaat selittää muiden mikrobien kuten virusten, sienten ja parasiittien diagnostisia menetelmiä. Osaat ottaa laadukkaasti kliinisen mikrobiologian näytteitä sekä ohjata muuta terveydenhuoltohenkilökuntaa mikrobiologisten näytteiden ottamiseen. Osaat arvioida kliiniseen mikrobiologiaan liittyviä preanalyyttisiä, analyyttisia- ja postanalyyttisia tekijöitä ja osaat soveltaa niitä käytännössä. Osaat noudattaa laadunhallinnan periaatteita. Osaat työskennellä kliinisen mikrobiologian laboratoriossa turvallisesti ja aseptisesti.

Content

Infektioepidemiologia ja infektioiden torjunnan vastainen organisaatio Suomessa
Tartuntatautilainsäädäntö ja mikrobiologisen laboratoriotoiminnan luvanvaraisuus
Mikrobit taudinaiheuttajina ja niiden aiheuttamat keskeiset infektiotaudit
Turvalliset ja aseptiset työskentelytavat
Kliinisten mikrobiologisten näytteiden otto, käsittely ja kuljetus.
Yleisimmät aerobimikrobiryhmät, mikrobien rakenne, ominaisuudet, lisääntyminen ja kasvuvaatimukset
Mikrobilääkkeet, niiden vaikutus- ja resistenssimekanismit, herkkyysmääritys
Resistentit bakteerit
Bakteerigenetiikan määritysmenetelmät
Yleisimpien parasiittien laboratoriotutkimusmenetelmät, ulosteen parasiittien tunnistus
Sienten viljely kasvatusalustoille, hiiva- ja rihmasienten laboratoriodiagnostiikka
Antimykoottiset lääkeainetutkimukset hiivasienillä.
Virusten tutkimukset, vasta-aine, antigeenienosoitusmenetelmät, fluoresenssin hyödyntäminen tutkimusmenetelmissä.
MALDI-TOF MS menetelmän käyttö

Location and time

22.10.2024 - 2012.24
Opintojakso alkaa 22.10.2024 pakollisella orientaatiolla. Orientaatiossa varmistetaan paikka opintojaksolla.

Materials

Soveltuvin osin
Mikrobiologia; mikrobiologia, immunologia ja infektiosairaudet kirjat 1 ja 2. Duodecim. Hedman, Heikkinen, Huovinen, Järvinen, Meri, Vaara. Kirjasarja löytyy myös verkkokirjana.
Annetut artikkelit
Moodle materiaali
Muu ilmoitettu materiaali

Teaching methods

Teorialuennnot
Itsenäinen opiskelu
Erilaiset tehtävät Moodlessa
Laboraatiot


Opettajan laatimat tehtävät ja materiaalit ovat Tekijänoikeuslain (404/61) mukaisia teoksia, joihin opettajalla on tekijänoikeus. Tehtäviä ja materiaalit ei saa käyttää muuten kuin omissa opinnoissaan. Niiden julkinen levittäminen on sallittua vain opettajan luvalla. Nauhoitettuja luentoja ei ole lupa levittää eteenpäin. Luentojen tallentaminen erillistä opettajan lupaa on myös kielletty, sillä opintojaksolla saatetaan käsitellä aiheeseen liittyviä tapahtumia tai osallistujien omakohtaisia kokemuksia.

Exam schedules

Tentti 16.12.24 Tiedot Moodle ja lukujärjestys. Tentti on Metropolian Myllypuron kampuksella.
Uusinnat: helmikuussa- 25 (helmikuussa myös arvosanan korotus) ja maaliskuussa -25. Päivät ilmoitetaan orientaatiossa.
Jos uusintakertaan ei osallistu, menettää tenttikerran. Jos tentistä ei pääse läpi annetuilla uusintakerroilla, tulee opintojaksolle osallistua kokonaisuudessaan uudelleen.

Completion alternatives

-

Student workload

Opintojakso 10op = 270h Laboraatio opetus 5op, teoria 5op
Tehtävät ja opintojakson sisältö käydään läpi orientaatiossa.

Content scheduling

Opintojakso sisältää kliinistä bakteriologiaa, virologiaa, parasitologiaa ja mykologiaa.

Further information

Opintojakson opettajat
Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman, vastuuopettaja

Opintojaksolle ilmoittautuminen ilmoittautumisaikana. Jälki-ilmoittautumisia ei huomioida. Pakollisessa orientaatiossa läsnäololla varmistetaan paikka opintojaksolla.

Mikäli sinulla on osittainen AHOT tai/ja mikäli sinulla on päätös yksilöllisisistä opetusjärjestelyistä/opetuksen erityisjärjestelyistä, sinun tulee ilmoittaa niistä opintojakson vastuuopettajalle viimeistään 31.5.24

Laboraatio-opetus on pakollisia. Laboraatio-opetuksessa tulee olla asianmukainen vaatetus.
Opiskelijan tulee valmistautua laboraatio-opetukseen etukäteismateriaalien avulla.
Opintojakso voi sisältää pakollisia teoriatunteja, mitkä on merkitty lukujärjestykseen.

HUOM! Huomioi opintojakson vaadittavat edeltävät opinnot. Edeltävät opinnot tulee olla suoritettu (arvosana opintorekisterissä).


Muutokset lukujärjestyksessä ovat mahdollisia.
Lisäinformaatiot Moodle työtilassa. Työtilan avaimen saa orientaatio luennolla.

Ilmoittautumisten hyväksymisen periaatteet
- ensin hyväksytään ne opiskelijat, jotka kuuluvat siihen ryhmään, jolle toteutus on suunnattu
- toiseksi hyväksytään aikaisimmilta opintojaksoilta jääneet ja nopeuttajat, mikäli opintojaksolla on paikkoja
- kolmanneksi mahdolliset muut hyväksymismenettelytavat.

Mikäli suorituksia/tehtäviä ei ole tehty 2. uusintatenttipäivämäärään mennessä, toteutus arvioidaan hylätyksi ja opiskelijan on ilmoittauduttava uudelle toteutukselle.
Pääsääntöisesti puuttuva(t) laboraatio(t) korvataan seuraavan sovitun toteutuksen yhteydessä.

Palauttamalla verkkotentin tai verkkototeutuksen tehtävät opiskelija vakuuttaa osaamisen osoittamisensa perustuvan itsenäiseen tekemiseen ja eettiseen toimintaan. Vilppi voi johtaa jopa vuoden määräaikaiseen erottamiseen ammattikorkeakoulusta. Ammattikorkeakoululaki 932/2014, 38 §. Verkkototeutuksen itsenäisen osaamisen varmistamiseksi opettaja voi harkintansa mukaan edellyttää osaamisen osoittamista valvotuissa olosuhteissa tai suullisella tentillä.

Evaluation scale

0-5

Assessment criteria, satisfactory (1)

0-5
Arviointikehikko, ks liite.
Osaamisen arvioinnissa käytetään arviointikriteerien tasoa edistynyt.

Prerequisites

Edeltävä osaaminen:

Olet saavuttanut seuraavien opintojaksojen osaamistavoitteet: Anatomia, fysiologia ja patofysiologia, Preanalytiikan ja näytteenoton osaajaksi, Laboratoriotyön perusteet, Kemia, Tilastomatematiikka ja laboratoriotyön fysikaaliset sovellukset, Immunologia, Solubiologia, Biokemia ja lääketieteen perusteet

Enrollment

27.11.2023 - 10.12.2023

Timing

18.03.2024 - 26.05.2024

Number of ECTS credits allocated

10 op

Virtual portion

2 op

Mode of delivery

80 % Contact teaching, 20 % Distance learning

Unit

School of Rehabilitation and Examination

Campus

Myllypurontie 1

Teaching languages
  • Finnish
Seats

12 - 49

Degree programmes
  • Biomedical Laboratory Science
Teachers
  • Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman
  • Heidi Malava
Teacher in charge

Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman

Groups
  • SXJ22K2
    Bioanalytiikan tutkinto-ohjelma, monimuoto

Objective

Opiskelijana osaat kuvata, miten infektioidenvastainen toiminta on organisoitu Suomessa ja miten lainsäädäntö ohjaa kliinisen mikrobiologian laboratoriotoimintaa. Osaat nimetä yleisimmät aerobimikrobit, niiden ominaisuudet sekä niiden aiheuttamat infektiotaudit. Osaat tehdä kliinisen bakteriologian yleisempiä tutkimuksia ja ymmärtää niiden periaatteita. Osaat selittää muiden mikrobien kuten virusten, sienten ja parasiittien diagnostisia menetelmiä. Osaat ottaa laadukkaasti kliinisen mikrobiologian näytteitä sekä ohjata muuta terveydenhuoltohenkilökuntaa mikrobiologisten näytteiden ottamiseen. Osaat arvioida kliiniseen mikrobiologiaan liittyviä preanalyyttisiä, analyyttisia- ja postanalyyttisia tekijöitä ja osaat soveltaa niitä käytännössä. Osaat noudattaa laadunhallinnan periaatteita. Osaat työskennellä kliinisen mikrobiologian laboratoriossa turvallisesti ja aseptisesti.

Content

Infektioepidemiologia ja infektioiden torjunnan vastainen organisaatio Suomessa
Tartuntatautilainsäädäntö ja mikrobiologisen laboratoriotoiminnan luvanvaraisuus
Mikrobit taudinaiheuttajina ja niiden aiheuttamat keskeiset infektiotaudit
Turvalliset ja aseptiset työskentelytavat
Kliinisten mikrobiologisten näytteiden otto, käsittely ja kuljetus.
Yleisimmät aerobimikrobiryhmät, mikrobien rakenne, ominaisuudet, lisääntyminen ja kasvuvaatimukset
Mikrobilääkkeet, niiden vaikutus- ja resistenssimekanismit, herkkyysmääritys
Resistentit bakteerit
Bakteerigenetiikan määritysmenetelmät
Yleisimpien parasiittien laboratoriotutkimusmenetelmät, ulosteen parasiittien tunnistus
Sienten viljely kasvatusalustoille, hiiva- ja rihmasienten laboratoriodiagnostiikka
Antimykoottiset lääkeainetutkimukset hiivasienillä.
Virusten tutkimukset, vasta-aine, antigeenienosoitusmenetelmät, fluoresenssin hyödyntäminen tutkimusmenetelmissä.
MALDI-TOF MS menetelmän käyttö

Location and time

27.03.2024 - 24.5.24
Opintojakso alkaa 27.03.2024 pakollisella orientaatiolla. Orientaatiossa varmistetaan paikka opintojaksolla.

Materials

Soveltuvin osin
Mikrobiologia; mikrobiologia, immunologia ja infektiosairaudet kirjat 1 ja 2. Duodecim. Hedman, Heikkinen, Huovinen, Järvinen, Meri, Vaara.
Annetut artikkelit
Moodle materiaali
Muu ilmoitettu materiaali

Teaching methods

Teorialuennnot
Itsenäinen opiskelu
Erilaiset tehtävät Moodlessa
Laboraatiot


Opettajan laatimat tehtävät ja materiaalit ovat Tekijänoikeuslain (404/61) mukaisia teoksia, joihin opettajalla on tekijänoikeus. Tehtäviä ja materiaalit ei saa käyttää muuten kuin omissa opinnoissaan. Niiden julkinen levittäminen on sallittua vain opettajan luvalla. Nauhoitettuja luentoja ei ole lupa levittää eteenpäin. Luentojen tallentaminen erillistä opettajan lupaa on myös kielletty, sillä opintojaksolla saatetaan käsitellä aiheeseen liittyviä tapahtumia tai osallistujien omakohtaisia kokemuksia.

Exam schedules

Tentti 24.5.24 Tiedot Moodle ja lukujärjestys. Tentti on Metropolian Myllypuron kampuksella.
Uusinnat ja arvosanan korotus: elokuussa - 24 ja syyskuu -24. Päivät ilmoitetaan orientaatiossa.
Jos uusintakertaan ei osallistu, menettää tenttikerran. Jos tentistä ei pääse läpi annetuilla uusintakerroilla, tulee opintojaksolle osallistua kokonaisuudessaan uudelleen.

Completion alternatives

-

Student workload

Opintojakso 10op = 270h Laboraatio opetus 5op, teoria 5op
Tehtävät ja opintojakson sisältö käydään läpi orientaatiossa.

Content scheduling

Opintojakso sisältää kliinistä bakteriologiaa, virologiaa, parasitologiaa ja mykologiaa.

Further information

Opintojakson opettajat
Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman (vastuuopettaja) Bakteriologia, virologian, mykologian
Heidi Malava, parasitologia

Opintojaksolle ilmoittautuminen ilmoittautumisaikana. Jälki-ilmoittautumisia ei huomioida. Pakollisessa orientaatiossa läsnäololla varmistetaan paikka opintojaksolla.

Mikäli sinulla on päätös yksilöllisisistä opetusjärjestelyistä/opetuksen erityisjärjestelyistä, sinun tulee ilmoittaa siitä ja tarpeestasi opintojakson vastuuopettajalle viimeistään 28.2.24

Laboraatiot suoritetaan intensiiviviikoilla. Laboraatiot ovat pakollisia. Laboraatioissa asianmukainen vaatetus.
Opiskelijan tulee valmistautua laboraatio opetukseen etukäteismateriaalien avulla.
Opintojakso voi sisältää pakollisia teoriatunteja, mitkä on merkitty lukujärjestykseen.

HUOM! Huomioi opintojakson vaadittavat edeltävät opinnot. Edeltävät opinnot tulee olla suoritettu (arvosana opintorekisterissä).
Jos opiskelijalla on osittainen AHOT, tulee päätös siitä toimittaa vastuuopettajalle kuukausi ennen opintojakson alkua.

Muutokset lukujärjestyksessä ovat mahdollisia.
Lisäinformaatiot Moodle työtilassa. Työtilan avaimen saa orientaatio luennolla.
Muutokset lukujärjestyksessä mahdollisia.
Ilmoittautumisten hyväksymisen periaatteet
- ensin hyväksytään ne opiskelijat, jotka kuuluvat siihen ryhmään, jolle toteutus on suunnattu
- toiseksi hyväksytään aikaisimmilta opintojaksoilta jääneet ja nopeuttajat, mikäli opintojaksolla on paikkoja
- kolmanneksi mahdolliset muut hyväksymismenettelytavat.

Mikäli suorituksia/tehtäviä ei ole tehty 2. uusintatenttipäivämäärään mennessä, toteutus arvioidaan hylätyksi ja opiskelijan on ilmoittauduttava uudelle toteutukselle.
Pääsääntöisesti puuttuva(t) laboraatio(t) korvataan seuraavan sovitun toteutuksen yhteydessä.

Palauttamalla verkkotentin tai verkkototeutuksen tehtävät opiskelija vakuuttaa osaamisen osoittamisensa perustuvan itsenäiseen tekemiseen ja eettiseen toimintaan. Vilppi voi johtaa jopa vuoden määräaikaiseen erottamiseen ammattikorkeakoulusta. Ammattikorkeakoululaki 932/2014, 38 §. Verkkototeutuksen itsenäisen osaamisen varmistamiseksi opettaja voi harkintansa mukaan edellyttää osaamisen osoittamista valvotuissa olosuhteissa tai suullisella tentillä.

Evaluation scale

0-5

Assessment criteria, satisfactory (1)

0-5
Arviointikehikko, ks liite.
Osaamisen arvioinnissa käytetään arviointikriteerien tasoa edistynyt.

Prerequisites

Edeltävä osaaminen:

Olet saavuttanut seuraavien opintojaksojen osaamistavoitteet: Anatomia, fysiologia ja patofysiologia, Preanalytiikan ja näytteenoton osaajaksi, Laboratoriotyön perusteet, Kemia, Tilastomatematiikka ja laboratoriotyön fysikaaliset sovellukset, Immunologia, Solubiologia, Biokemia ja lääketieteen perusteet

Enrollment

02.05.2023 - 14.05.2023

Timing

23.10.2023 - 31.12.2023

Number of ECTS credits allocated

10 op

Virtual portion

1 op

Mode of delivery

90 % Contact teaching, 10 % Distance learning

Unit

School of Rehabilitation and Examination

Campus

Myllypurontie 1

Teaching languages
  • Finnish
Seats

0 - 32

Degree programmes
  • Biomedical Laboratory Science
Teachers
  • Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman
  • Heidi Malava
Teacher in charge

Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman

Groups
  • SXJ21S1
    Bioanalytiikan tutkinto-ohjelma päivä

Objective

Opiskelijana osaat kuvata, miten infektioidenvastainen toiminta on organisoitu Suomessa ja miten lainsäädäntö ohjaa kliinisen mikrobiologian laboratoriotoimintaa. Osaat nimetä yleisimmät aerobimikrobit, niiden ominaisuudet sekä niiden aiheuttamat infektiotaudit. Osaat tehdä kliinisen bakteriologian yleisempiä tutkimuksia ja ymmärtää niiden periaatteita. Osaat selittää muiden mikrobien kuten virusten, sienten ja parasiittien diagnostisia menetelmiä. Osaat ottaa laadukkaasti kliinisen mikrobiologian näytteitä sekä ohjata muuta terveydenhuoltohenkilökuntaa mikrobiologisten näytteiden ottamiseen. Osaat arvioida kliiniseen mikrobiologiaan liittyviä preanalyyttisiä, analyyttisia- ja postanalyyttisia tekijöitä ja osaat soveltaa niitä käytännössä. Osaat noudattaa laadunhallinnan periaatteita. Osaat työskennellä kliinisen mikrobiologian laboratoriossa turvallisesti ja aseptisesti.

Content

Infektioepidemiologia ja infektioiden torjunnan vastainen organisaatio Suomessa
Tartuntatautilainsäädäntö ja mikrobiologisen laboratoriotoiminnan luvanvaraisuus
Mikrobit taudinaiheuttajina ja niiden aiheuttamat keskeiset infektiotaudit
Turvalliset ja aseptiset työskentelytavat
Kliinisten mikrobiologisten näytteiden otto, käsittely ja kuljetus.
Yleisimmät aerobimikrobiryhmät, mikrobien rakenne, ominaisuudet, lisääntyminen ja kasvuvaatimukset
Mikrobilääkkeet, niiden vaikutus- ja resistenssimekanismit, herkkyysmääritys
Resistentit bakteerit
Bakteerigenetiikan määritysmenetelmät
Yleisimpien parasiittien laboratoriotutkimusmenetelmät, ulosteen parasiittien tunnistus
Sienten viljely kasvatusalustoille, hiiva- ja rihmasienten laboratoriodiagnostiikka
Antimykoottiset lääkeainetutkimukset hiivasienillä.
Virusten tutkimukset, vasta-aine, antigeenienosoitusmenetelmät, fluoresenssin hyödyntäminen tutkimusmenetelmissä.
MALDI-TOF MS menetelmän käyttö

Location and time

Opintojakso alkaa 24.10 pakollisella orientaatiolla. Orientaatiossa varmistetaan paikka opintojaksolla.

Materials

Soveltuvin osin
Mikrobiologia; mikrobiologia, immunologia ja infektiosairaudet kirjat 1 ja 2. Duodecim. Hedman, Heikkinen, Huovinen, Järvinen, Meri, Vaara.
Annetut artikkelit
Moodle materiaali
Muu ilmoitettu materiaali

Teaching methods

Teorialuennnot
Itsenäinen opiskelu
Erilaiset tehtävät Moodlessa
Laboraatiot


Opettajan laatimat tehtävät ja materiaalit ovat Tekijänoikeuslain (404/61) mukaisia teoksia, joihin opettajalla on tekijänoikeus. Tehtäviä ja materiaalit ei saa käyttää muuten kuin omissa opinnoissaan. Niiden julkinen levittäminen on sallittua vain opettajan luvalla. Nauhoitettuja luentoja ei ole lupa levittää eteenpäin. Luentojen tallentaminen erillistä opettajan lupaa on myös kielletty, sillä opintojaksolla saatetaan käsitellä aiheeseen liittyviä tapahtumia tai osallistujien omakohtaisia kokemuksia.

Exam schedules

Tentit 1 ja 2. Tiedot Moodle ja lukujärjestys. Tentit ovat Metropolian Myllypuron kampuksella.
Uusinnat ja arvosanan korotus: yleisenä uusintapäivänä helmi- ja huhtikuussa -24. Muita uusintoja ei ole.
Jos uusintakertaan ei osallistu, menettää tenttikerran. Jos tentistä ei pääse läpi annetuilla uusintakerroilla, tulee opintojaksolle osallistua kokonaisuudessaan uudelleen.

Completion alternatives

-

Student workload

Opintojakso 10op = 270h Laboraatio opetus 5op, teoria 5op
Tehtävät ja opintojakson sisältö käydään läpi orientaatiossa.

Content scheduling

Opintojakso sisältää kliinistä bakteriologiaa, virologiaa, parasitologiaa ja mykologiaa.

Further information

Opintojakson opettajat
Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman (vastuuopettaja) Bakteriologia, virologian, mykologian
Heidi Malava, parasitologia

Opintojaksolle ilmoittautuminen ilmoittautumisaikana. Jälki-ilmoittautumisia ei huomioida. Pakollisessa orientaatiossa läsnäololla varmistetaan paikka opintojaksolla.

Mikäli sinulla on päätös yksilöllisisistä opetusjärjestelyistä/opetuksen erityisjärjestelyistä, sinun tulee ilmoittaa siitä ja tarpeestasi opintojakson vastuuopettajalle viimeistään 31.5.23

Laboraatiot ovat pakollisia. Laboraatioissa asianmukainen vaatetus.
Opiskelija valmistautuu laboraatio opetukseen etukäteismateriaalien avulla.
Opintojakso voi sisältää pakollisia teoriatunteja, merkitty lukujärjestykseen.


HUOM! Huomioi opintojakson vaadittavat edeltävät opinnot. Edeltävät opinnot tulee olla suoritettu (arvosana opintorekisterissä).
Jos opiskelijalla on osittainen AHOT, tulee päästös siitä toimittaa vastuuopettajalle kuukausi ennen opintojakson alkua.

Muutokset lukujärjestyksessä ovat mahdollisia.
Lisäinformaatiot Moodle työtilassa. Työtilan avaimen saa orientaatio luennolla.
Muutokset lukujärjestyksessä mahdollisia.
Ilmoittautumisten hyväksymisen periaatteet
- ensin hyväksytään ne opiskelijat, jotka kuuluvat siihen ryhmään, jolle toteutus on suunnattu
- toiseksi hyväksytään aikaisimmilta opintojaksoilta jääneet ja nopeuttajat, mikäli opintojaksolla on paikkoja
- mahdolliset muut hyväksymismenettelytavat.
Mikäli suorituksia/tehtäviä ei ole tehty 2. uusintatenttipäivämäärään mennessä, toteutus arvioidaan hylätyksi ja opiskelijan on ilmoittauduttava uudelle toteutukselle.
Pääsääntöisesti puuttuva(t) laboraatio(t) korvataan seuraavan sovitun toteutuksen yhteydessä.

Palauttamalla verkkotentin tai verkkototeutuksen tehtävät opiskelija vakuuttaa osaamisen osoittamisensa perustuvan itsenäiseen tekemiseen ja eettiseen toimintaan. Vilppi voi johtaa jopa vuoden määräaikaiseen erottamiseen ammattikorkeakoulusta. Ammattikorkeakoululaki 932/2014, 38 §. Verkkototeutuksen itsenäisen osaamisen varmistamiseksi opettaja voi harkintansa mukaan edellyttää osaamisen osoittamista valvotuissa olosuhteissa tai suullisella tentillä.

Evaluation scale

0-5

Assessment criteria, satisfactory (1)

0-5
Arviointikehikko, ks liite.
Osaamisen arvioinnissa käytetään arviointikriteerien tasoa edistynyt.

Prerequisites

Edeltävä osaaminen:

Olet saavuttanut seuraavien opintojaksojen osaamistavoitteet: Anatomia, fysiologia ja patofysiologia, Preanalytiikan ja näytteenoton osaajaksi, Laboratoriotyön perusteet, Kemia, Tilastomatematiikka ja laboratoriotyön fysikaaliset sovellukset, Immunologia, Solubiologia, Biokemia ja lääketieteen perusteet

Enrollment

28.11.2022 - 11.12.2022

Timing

18.01.2023 - 31.05.2023

Number of ECTS credits allocated

10 op

Virtual portion

1 op

Mode of delivery

90 % Contact teaching, 10 % Distance learning

Unit

School of Rehabilitation and Examination

Campus

Myllypurontie 1

Teaching languages
  • Finnish
Seats

12 - 32

Degree programmes
  • Biomedical Laboratory Science
Teachers
  • Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman
  • Heidi Malava
Teacher in charge

Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman

Groups
  • SXJ21K2
    Bioanalytiikan tutkinto-ohjelma, monimuoto

Objective

Opiskelijana osaat kuvata, miten infektioidenvastainen toiminta on organisoitu Suomessa ja miten lainsäädäntö ohjaa kliinisen mikrobiologian laboratoriotoimintaa. Osaat nimetä yleisimmät aerobimikrobit, niiden ominaisuudet sekä niiden aiheuttamat infektiotaudit. Osaat tehdä kliinisen bakteriologian yleisempiä tutkimuksia ja ymmärtää niiden periaatteita. Osaat selittää muiden mikrobien kuten virusten, sienten ja parasiittien diagnostisia menetelmiä. Osaat ottaa laadukkaasti kliinisen mikrobiologian näytteitä sekä ohjata muuta terveydenhuoltohenkilökuntaa mikrobiologisten näytteiden ottamiseen. Osaat arvioida kliiniseen mikrobiologiaan liittyviä preanalyyttisiä, analyyttisia- ja postanalyyttisia tekijöitä ja osaat soveltaa niitä käytännössä. Osaat noudattaa laadunhallinnan periaatteita. Osaat työskennellä kliinisen mikrobiologian laboratoriossa turvallisesti ja aseptisesti.

Content

Infektioepidemiologia ja infektioiden torjunnan vastainen organisaatio Suomessa
Tartuntatautilainsäädäntö ja mikrobiologisen laboratoriotoiminnan luvanvaraisuus
Mikrobit taudinaiheuttajina ja niiden aiheuttamat keskeiset infektiotaudit
Turvalliset ja aseptiset työskentelytavat
Kliinisten mikrobiologisten näytteiden otto, käsittely ja kuljetus.
Yleisimmät aerobimikrobiryhmät, mikrobien rakenne, ominaisuudet, lisääntyminen ja kasvuvaatimukset
Mikrobilääkkeet, niiden vaikutus- ja resistenssimekanismit, herkkyysmääritys
Resistentit bakteerit
Bakteerigenetiikan määritysmenetelmät
Yleisimpien parasiittien laboratoriotutkimusmenetelmät, ulosteen parasiittien tunnistus
Sienten viljely kasvatusalustoille, hiiva- ja rihmasienten laboratoriodiagnostiikka
Antimykoottiset lääkeainetutkimukset hiivasienillä.
Virusten tutkimukset, vasta-aine, antigeenienosoitusmenetelmät, fluoresenssin hyödyntäminen tutkimusmenetelmissä.
MALDI-TOF MS menetelmän käyttö

Location and time

Opintojakso alkaa 18.1.23 pakollisella orientaatiolla. Orientaatiossa varmistetaan paikka opintojaksolla.

Materials

Soveltuvin osin
Mikrobiologia; mikrobiologia, immunologia ja infektiosairaudet kirjat 1 ja 2. Duodecim. Hedman, Heikkinen, Huovinen, Järvinen, Meri, Vaara.
Hoitoon liittyvien infektioiden torjunta 2010 tai uudempi. Anttila ym.
Annetut artikkelit
Moodle materiaali
Muu ilmoitettu materiaali

Teaching methods

Aktivoivat teorialuennot Zoom-yhteydellä. Kaikkia luentoja ei tallenneta. Tallennetut luennot ovat kuunneltavissa kaksi viikkoa.
Erilaiset Moodlessa olevat yksilötehtävät.
Laboraatiot


Opettajan laatimat tehtävät ja materiaalit ovat Tekijänoikeuslain (404/61) mukaisia teoksia, joihin opettajalla on tekijänoikeus. Tehtäviä ja materiaalit ei saa käyttää muuten kuin omissa opinnoissaan. Niiden julkinen levittäminen on sallittua vain opettajan luvalla. Nauhoitettuja luentoja ei ole lupa levittää eteenpäin.

Exam schedules

Tentit 1 ja 2. Tiedot Moodle ja lukujärjestys. Tentit Metropolia ovat Myllypuron kampuksella.
Uusinnat: yleisenä uusintapäivänä kesäkuussa ja elokuussa -23 Muita uusintoja ei ole. Arvosanan korotustentti yleisenä uusintapäivänä kesäkuussa ja elokuussa
Jos uusintakertaan ei osallistu, menettää tenttikerran. Jos tentistä ei pääse läpi annetuilla uusintakerroilla, tulee opintojaksolle osallistua kokonaisuudessaan uudelleen.

International connections

Bionord yhteistyöseminaari pohjoismaiden kanssa (Suomi, Ruotsi, Norja, Tanska): Antimicrobial resistance in Nordic counties

Completion alternatives

-

Student workload

Opintojakso 10op = 270h Laboraatio opetus 5op, teoria 5op
Tehtävät ja opintojakson sisältö käydään läpi orientaatiossa.

Content scheduling

Opintojakso sisältää kliinistä bakteriologiaa, virologiaa, parasitologiaa ja mykologiaa.

Further information

Opintojakson opettajat
Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman (vastuuopettaja) Bakteriologia, virologian, mykologian
Heidi Malava, parasitologia

Opintojaksolle ilmoittautuminen ilmoittautumisaikana. Jälki-ilmoittautumisia ei huomioida. Pakollisessa orientaatiossa läsnäololla varmistetaan paikka opintojaksolla.

Mikäli sinulla on päätös yksilöllisisistä opetusjärjestelyistä/opetuksen erityisjärjestelyistä, sinun tulee ilmoittaa siitä ja tarpeestasi opintojakson vastuuopettajalle viimeistään 9.1.23

Laboraatiot ovat pakollisia. Laboraatioissa asianmukainen vaatetus.
Opiskelija valmistautuu laboraatio opetukseen etukäteismateriaalien avulla.
Opintojakso voi sisältää pakollisia teoriatunteja, merkitty lukujärjestykseen.
Työkoe. Työkokeeseen osallistuminen edellyttää, että kaikki laboraatiot on suoritettu ja laboraatiopäiväkirjat on palautettu ennen työkoetta annettuihin päivämääriin mennessä.

HUOM! Huomioi opintojakson vaadittavat edeltävät opinnot. Edeltävät opinnot tulee olla suoritettu (arvosana opintorekisterissä).

Lisäinformaatiot Moodle työtilassa. Työtilan avaimen saa orientaatio luennolla.
Muutokset lukujärjestyksessä mahdollisia.
Ilmoittautumisten hyväksymisen periaatteet
- ensin hyväksytään ne opiskelijat, jotka kuuluvat siihen ryhmään, jolle toteutus on suunnattu
- toiseksi hyväksytään nopeuttajat, mikäli opintojaksolla on paikkoja
- mahdolliset muut hyväksymismenettelytavat.
Mikäli suorituksia/tehtäviä ei ole tehty 2. uusintatenttipäivämäärään mennessä, toteutus arvioidaan hylätyksi ja opiskelijan on ilmoittauduttava uudelle toteutukselle.
Pääsääntöisesti puuttuva(t) laboraatio(t) korvataan seuraavan sovitun toteutuksen yhteydessä.

Palauttamalla verkkotentin tai verkkototeutuksen tehtävät opiskelija vakuuttaa osaamisen osoittamisensa perustuvan itsenäiseen tekemiseen ja eettiseen toimintaan. Vilppi voi johtaa jopa vuoden määräaikaiseen erottamiseen ammattikorkeakoulusta. Ammattikorkeakoululaki 932/2014, 38 §. Verkkototeutuksen itsenäisen osaamisen varmistamiseksi opettaja voi harkintansa mukaan edellyttää osaamisen osoittamista valvotuissa olosuhteissa tai suullisella tentillä.

Evaluation scale

0-5

Assessment criteria, satisfactory (1)

0-5
Arviointikehikko, ks liite.
Osaamisen arvioinnissa käytetään arviointikriteerien tasoa edistynyt.

Prerequisites

Edeltävä osaaminen:

Olet saavuttanut seuraavien opintojaksojen osaamistavoitteet: Anatomia, fysiologia ja patofysiologia, Preanalytiikan ja näytteenoton osaajaksi, Laboratoriotyön perusteet, Kemia, Tilastomatematiikka ja laboratoriotyön fysikaaliset sovellukset, Immunologia, Solubiologia, Biokemia ja lääketieteen perusteet

Enrollment

02.05.2022 - 15.05.2022

Timing

24.10.2022 - 23.12.2022

Number of ECTS credits allocated

10 op

Virtual portion

1 op

Mode of delivery

90 % Contact teaching, 10 % Distance learning

Unit

School of Rehabilitation and Examination

Campus

Myllypurontie 1

Teaching languages
  • Finnish
Seats

12 - 32

Degree programmes
  • Biomedical Laboratory Science
Teachers
  • Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman
  • Heidi Malava
  • Bioanalytiikka1 Virtuaali
Teacher in charge

Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman

Groups
  • SXJ20S1
    Bioanalytiikan tutkinto-ohjelma päivä

Objective

Opiskelijana osaat kuvata, miten infektioidenvastainen toiminta on organisoitu Suomessa ja miten lainsäädäntö ohjaa kliinisen mikrobiologian laboratoriotoimintaa. Osaat nimetä yleisimmät aerobimikrobit, niiden ominaisuudet sekä niiden aiheuttamat infektiotaudit. Osaat tehdä kliinisen bakteriologian yleisempiä tutkimuksia ja ymmärtää niiden periaatteita. Osaat selittää muiden mikrobien kuten virusten, sienten ja parasiittien diagnostisia menetelmiä. Osaat ottaa laadukkaasti kliinisen mikrobiologian näytteitä sekä ohjata muuta terveydenhuoltohenkilökuntaa mikrobiologisten näytteiden ottamiseen. Osaat arvioida kliiniseen mikrobiologiaan liittyviä preanalyyttisiä, analyyttisia- ja postanalyyttisia tekijöitä ja osaat soveltaa niitä käytännössä. Osaat noudattaa laadunhallinnan periaatteita. Osaat työskennellä kliinisen mikrobiologian laboratoriossa turvallisesti ja aseptisesti.

Content

Infektioepidemiologia ja infektioiden torjunnan vastainen organisaatio Suomessa
Tartuntatautilainsäädäntö ja mikrobiologisen laboratoriotoiminnan luvanvaraisuus
Mikrobit taudinaiheuttajina ja niiden aiheuttamat keskeiset infektiotaudit
Turvalliset ja aseptiset työskentelytavat
Kliinisten mikrobiologisten näytteiden otto, käsittely ja kuljetus.
Yleisimmät aerobimikrobiryhmät, mikrobien rakenne, ominaisuudet, lisääntyminen ja kasvuvaatimukset
Mikrobilääkkeet, niiden vaikutus- ja resistenssimekanismit, herkkyysmääritys
Resistentit bakteerit
Bakteerigenetiikan määritysmenetelmät
Yleisimpien parasiittien laboratoriotutkimusmenetelmät, ulosteen parasiittien tunnistus
Sienten viljely kasvatusalustoille, hiiva- ja rihmasienten laboratoriodiagnostiikka
Antimykoottiset lääkeainetutkimukset hiivasienillä.
Virusten tutkimukset, vasta-aine, antigeenienosoitusmenetelmät, fluoresenssin hyödyntäminen tutkimusmenetelmissä.
MALDI-TOF MS menetelmän käyttö

Location and time

Opintojakso alkaa 24.10.22 pakollisella orientaatiolla. Orientaatiossa varmistetaan paikka opintojaksolla.

Materials

Soveltuvin osin
Mikrobiologia; mikrobiologia, immunologia ja infektiosairaudet kirjat 1 ja 2. Duodecim. Hedman, Heikkinen, Huovinen, Järvinen, Meri, Vaara.
Hoitoon liittyvien infektioiden torjunta 2010 tai uudempi. Anttila ym.
Annetut artikkelit
Moodle materiaali
Muu ilmoitettu materiaali

Teaching methods

Aktivoivat teorialuennot Zoom-yhteydellä. Kaikkia luentoja ei tallenneta. Tallennetut luennot ovat kuunneltavissa kaksi viikkoa.
Erilaiset Moodlessa olevat ryhmä- ja yksilötehtävät.
Laboraatiot
Oppimispäiväkirjat

Opettajan laatimat tehtävät ja materiaalit ovat Tekijänoikeuslain (404/61) mukaisia teoksia, joihin opettajalla on tekijänoikeus. Tehtäviä ja materiaalit ei saa käyttää muuten kuin omissa opinnoissaan. Niiden julkinen levittäminen on sallittua vain opettajan luvalla. Nauhoitettuja luentoja ei ole lupa levittää eteenpäin.

Exam schedules

TentIT 1 ja 2. Tiedot Moodle ja lukujärjestys. Tentit Metropolia Myllypuron kampuksella.
Uusinnat: helmikuussa -23 ja huhtikuussa -23 Muita uusintoja ei ole. Arvosanan korotustentti helmikuussa -23-
Jos uusintakertaan ei osallistu, menettää tenttikerran. Jos tentistä ei pääse läpi annetuilla uusintakerroilla, tulee opintojaksolle osallistua kokonaisuudessaan uudelleen.

International connections

-

Completion alternatives

-

Student workload

Opintojakso 10op = 270h Laboraatio opetus 5op, teoria 5op
Teoriaopetus, laboraatiot
Itsenäinen työskentely

Content scheduling

Opintojakso sisältää kliinistä bakteriologiaa, virologiaa, parasitologiaa ja mykologiaa.

Further information

Opintojakson opettajat
Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman (vastuuopettaja) Bakteriologia, virologian, mykologian
Heidi Malava, parasitologia

Opintojaksolle ilmoittautuminen ilmoittautumisaikana. Jälki-ilmoittautumisia ei huomioida. Pakollisessa orientaatiossa läsnäololla varmistetaan paikka opintojaksolla.

Mikäli sinulla on päätös yksilöllisisistä opetusjärjestelyistä/opetuksen erityisjärjestelyistä, sinun tulee ilmoittaa siitä ja tarpeestasi opintojakson vastuuopettajalle viimeistään 30.8.22

Laboraatiot ovat pakollisia. Laboraatioissa asianmukainen vaatetus.
Opiskelija valmistautuu laboraatio opetukseen etukäteismateriaalien avulla.
Opintojakso voi sisältää pakollisia teoriatunteja, merkitty lukujärjestykseen.
Työkoe. Työkokeeseen osallistuminen edellyttää, että kaikki laboraatiot on suoritettu ja laboraatiopäiväkirjat on palautettu ennen työkoetta annettuihin päivämääriin mennessä.

HUOM! Huomioi opintojakson vaadittavat edeltävät opinnot. Edeltävät opinnot tulee olla suoritettu.

Lisäinformaatiot Moodle työtilassa. Työtilan avaimen saa orientaatio luennolla.
Muutokset lukujärjestyksessä mahdollisia.
Ilmoittautumisten hyväksymisen periaatteet
- ensin hyväksytään ne opiskelijat, jotka kuuluvat siihen ryhmään, jolle toteutus on suunnattu
- toiseksi hyväksytään nopeuttajat, mikäli opintojaksolla on paikkoja
- mahdolliset muut hyväksymismenettelytavat.
Mikäli suorituksia/tehtäviä ei ole tehty 2. uusintatenttipäivämäärään mennessä, toteutus arvioidaan hylätyksi ja opiskelijan on ilmoittauduttava uudelle toteutukselle.
Pääsääntöisesti puuttuva(t) laboraatio(t) korvataan seuraavan sovitun toteutuksen yhteydessä.

Palauttamalla verkkotentin tai verkkototeutuksen tehtävät opiskelija vakuuttaa osaamisen osoittamisensa perustuvan itsenäiseen tekemiseen ja eettiseen toimintaan. Vilppi voi johtaa jopa vuoden määräaikaiseen erottamiseen ammattikorkeakoulusta. Ammattikorkeakoululaki 932/2014, 38 §. Verkkototeutuksen itsenäisen osaamisen varmistamiseksi opettaja voi harkintansa mukaan edellyttää osaamisen osoittamista valvotuissa olosuhteissa tai suullisella tentillä.

Evaluation scale

0-5

Assessment criteria, satisfactory (1)

0-5
Arviointikehikko, ks liite.
Osaamisen arvioinnissa käytetään arviointikriteerien tasoa edistynyt.

Prerequisites

Edeltävä osaaminen:

Olet saavuttanut seuraavien opintojaksojen osaamistavoitteet: Anatomia, fysiologia ja patofysiologia, Preanalytiikan ja näytteenoton osaajaksi, Laboratoriotyön perusteet, Kemia, Tilastomatematiikka ja laboratoriotyön fysikaaliset sovellukset, Immunologia, Solubiologia, Biokemia ja lääketieteen perusteet