Clinical Microbiology (10 cr)

Objective

Learning outcomes
As a student you are able to describe the organisation of infection control in Finland and explain the legislation governing clinical microbiological laboratory activities. You can name the most common aerobic bacteria, their characteristics and the infectious diseases they cause. You can perform the most common clinical bacteriology tests and understand their principles. You are able to explain the diagnostic methods used for other microbes, such as viruses, fungi and parasites. You are able to collect high-quality clinical microbiological samples and to guide other health care personnel in taking microbiological samples. You assess pre-analytical, analytical and post-analytical factors related to clinical microbiology and are able to apply them in your work. You adhere to the principles of quality management. You know how to work safely and aseptically in a clinical microbiology laboratory.

Content

Contents
Infection epidemiology and organisation of infection control in Finland
Legislation governing communicable diseases and authorisation of microbiological laboratory activities
Microbes as the cause of diseases and the key infectious diseases they cause
Safe and aseptic work procedures
Collection, handling and transportation of clinical microbiological samples
The most common aerobic microbe groups; the structure, characteristics, multiplication and growth requirements of microbes
Antimicrobial drugs, their effect and resistance mechanisms, determination of sensitivity
Resistant bacteria
Analysis methods in bacterial genetics
Methods of analysing the most common parasites, identification of faecal parasites
cultivation of fungi on culture media, laboratory diagnostics of yeast and filamentous fungi
Antimycotic drug studies on yeasts
Virology, antibody tests, antigen detection methods, utilisation of fluorescence in test methods.
Use of the MALDI-TOF MS technique

Location and time

Opintojakso alkaa 18.1.23 pakollisella orientaatiolla. Orientaatiossa varmistetaan paikka opintojaksolla.

Materials

Mikrobiologia, immunologia ja infektiosairaudet kirjat 1 ja 3. Duodecim. Hedman, Heikkinen, Huovinen, Järvinen, Meri, Vaara.
Materials at Moodle

Teaching methods

Tuition in Finnish.
Laboratory instractions, learning diary, Moodle tasks.

Exam schedules

Tentit 1 ja 2. Tiedot Moodle ja lukujärjestys. Tentit Metropolia ovat Myllypuron kampuksella.
Uusinnat: yleisenä uusintapäivänä kesäkuussa ja elokuussa -23 Muita uusintoja ei ole. Arvosanan korotustentti yleisenä uusintapäivänä kesäkuussa ja elokuussa
Jos uusintakertaan ei osallistu, menettää tenttikerran. Jos tentistä ei pääse läpi annetuilla uusintakerroilla, tulee opintojaksolle osallistua kokonaisuudessaan uudelleen.

International connections

Bionord yhteistyöseminaari pohjoismaiden kanssa (Suomi, Ruotsi, Norja, Tanska): Antimicrobial resistance in Nordic counties

Completion alternatives

N/A

Student workload

Opintojakso 10op = 270h Laboraatio opetus 5op, teoria 5op
Tehtävät ja opintojakson sisältö käydään läpi orientaatiossa.

Content scheduling

Opintojakso sisältää kliinistä bakteriologiaa, virologiaa, parasitologiaa ja mykologiaa.

Further information

Opintojakson opettajat
Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman (vastuuopettaja) Bakteriologia, virologian, mykologian
Heidi Malava, parasitologia

Opintojaksolle ilmoittautuminen ilmoittautumisaikana. Jälki-ilmoittautumisia ei huomioida. Pakollisessa orientaatiossa läsnäololla varmistetaan paikka opintojaksolla.

Mikäli sinulla on päätös yksilöllisisistä opetusjärjestelyistä/opetuksen erityisjärjestelyistä, sinun tulee ilmoittaa siitä ja tarpeestasi opintojakson vastuuopettajalle viimeistään 9.1.23

Laboraatiot ovat pakollisia. Laboraatioissa asianmukainen vaatetus.
Opiskelija valmistautuu laboraatio opetukseen etukäteismateriaalien avulla.
Opintojakso voi sisältää pakollisia teoriatunteja, merkitty lukujärjestykseen.
Työkoe. Työkokeeseen osallistuminen edellyttää, että kaikki laboraatiot on suoritettu ja laboraatiopäiväkirjat on palautettu ennen työkoetta annettuihin päivämääriin mennessä.

HUOM! Huomioi opintojakson vaadittavat edeltävät opinnot. Edeltävät opinnot tulee olla suoritettu (arvosana opintorekisterissä).

Lisäinformaatiot Moodle työtilassa. Työtilan avaimen saa orientaatio luennolla.
Muutokset lukujärjestyksessä mahdollisia.
Ilmoittautumisten hyväksymisen periaatteet
- ensin hyväksytään ne opiskelijat, jotka kuuluvat siihen ryhmään, jolle toteutus on suunnattu
- toiseksi hyväksytään nopeuttajat, mikäli opintojaksolla on paikkoja
- mahdolliset muut hyväksymismenettelytavat.
Mikäli suorituksia/tehtäviä ei ole tehty 2. uusintatenttipäivämäärään mennessä, toteutus arvioidaan hylätyksi ja opiskelijan on ilmoittauduttava uudelle toteutukselle.
Pääsääntöisesti puuttuva(t) laboraatio(t) korvataan seuraavan sovitun toteutuksen yhteydessä.

Palauttamalla verkkotentin tai verkkototeutuksen tehtävät opiskelija vakuuttaa osaamisen osoittamisensa perustuvan itsenäiseen tekemiseen ja eettiseen toimintaan. Vilppi voi johtaa jopa vuoden määräaikaiseen erottamiseen ammattikorkeakoulusta. Ammattikorkeakoululaki 932/2014, 38 §. Verkkototeutuksen itsenäisen osaamisen varmistamiseksi opettaja voi harkintansa mukaan edellyttää osaamisen osoittamista valvotuissa olosuhteissa tai suullisella tentillä.

Evaluation scale

0-5

Assessment criteria, satisfactory (1)

Assessment criteria
0–5
Assessment framework, see the appendix.
Assessment criteria for advanced level are applied.

Qualifications

Prior competence
Anatomy, Physiology and Pathophysiology, Pre-analytics, Methods in Laboratory Work, Chemistry, Mathematics and Physics, Immunology, Cell Biology, Biochemistry and Basics of Medicine.

Qualifications

Prior competence
Anatomy, Physiology and Pathophysiology, Pre-analytics, Methods in Laboratory Work, Chemistry, Mathematics and Physics, Immunology, Cell Biology, Biochemistry and Basics of Medicine.