Soveltava molekyylibiologia (6 op)

Tavoitteet

Opiskelija syventää tietämystään molekyylibiologiasta ja osaa soveltaa teoriatuntemustaan laboratoriossa käyttäen moderneja molekyylibiologisia tutkimusmenetelmiä. Opiskelija osaa suunnitella rekombinanttiproteiinituoton ja sen puhdistuksen suomalaista lainsäädäntöä ja GMP-ohjeita noudattaen.

Sisältö

1. qPCR ja muut ajankohtaiset DNA-analysointimenetelmät
2. Rekombinanttiproteiinituotto ja jälkikäsittelymenetelmät
3. Laboratoriotyöskentely

Esitietovaatimukset

TX00AD01 Mikrobiologia I
TB00AB09 Biokemian laboratoriotyöt
TX00AD02 Geenitekniikka

Työmuodot

Luennot
Laboratoriotyöt

Oppimateriaali ja suositeltava kirjallisuus

Luennot

Arviointimenetelmät ja arvioinnin perusteet

Tentti 50%
Laboratoriotyöskentelytaidot 20%
Raportit 30%

Arviointiasteikko

0-5

Arviointikriteerit arvosanalle 1 tyydyttävä

1. Opiskelija osaa selittää qPCR:n ja muiden valittujen DNA-analysointimenetelmien toimintaperiaatteet.
2. Opiskelija tietää rekombinanttiproteiinituottoon ja jälkikäsittelyprosessiin liittyvät käsitteet ja työvaiheet.
3. Opiskelija osaa työskennellä laboratoriossa turvallisesti. Hän osaa käsitellä laboratoriolaitteita, työvälineitä ja reagensseja oikein. Raportti vastaa malliselostuksen rakennetta ja sisältää kaikki vaaditut osiot eikä sisällä asiavirheitä. Tulokset on ilmoitettu oikealla tarkkuudella. Opiskelija osaa toimia ryhmän jäsenenä toisia kunnioittaen.

Arviointikriteerit arvosanalle 3 hyvä

1. Opiskelija osaa suunnitella qPCR-reaktion työohjeen ja valita tarkoituksenmukaisimman DNA-analyysimenetelmän näytteen ja tutkimustavoitteen mukaan.
2. Opiskelija osaa suunnitella rekombinanttiproteiinituoton ja jälkikäsittelyprosessin malliproteiinille.
3. Opiskelija työskentelee huolellisesti ja tavoitteellisesti. Raportti on selkeä rakenteeltaan ja siinä on painotettu oikeita asioita. Opiskelija osaa tehdä itsenäisesti johtopäätöksiä tuloksista. Opiskelija osaa neuvotella työnjaosta ja hyväksyy ryhmän päätökset.

Arviointikriteerit arvosanalle 5 kiitettävä

1. Opiskelija osaa kriittisesti arvioida qPCR:n ja muiden valittujen DNA-analyysimenetelmien heikkouksia ja vahvuuksia sekä ehdottaa korvaavia menetelmiä.
2. Opiskelija tietää miten rekombinanttiproteiinituottoa ja jälkikäsittelyprosessia säädellään ja osaa huomioida toteutuksessa GMP-säädökset ja suomalaisen lainsäädännön.
3. Opiskelija osaa suunnitella ja aikatauluttaa työnsä järkevästi. Hän työskentelee laboratoriossa oma-aloitteisesti ja laadukkaasti. Raportti on palautettu aikataulussa ja sen kieliasu on erinomainen. Raportissa teoria ja käytäntö yhdistyvät luontevasti ja opiskelija on käyttänyt kattavasti luotettavia lähteitä. Opiskelija valmistautuu etukäteen ryhmän tapaamisiin, tiedottaa muutoksista muita ja huolehtii laboratoriotöiden kokonaistilanteesta omalta osaltaan.