Bakteerien identifiointiprojekti (5 op)

Tavoitteet

Opintojaksossa opiskelija osallistuu biologisen riskinarvioinnin laatimiseen ja toimii projektiryhmän jäsenenä tuntemattoman bakteerin identifioimiseksi. Käytännön toteutusvaiheessa hän käyttää keskeisimpiä biokemiallisia, mikrobiologisia ja molekyylibiologisia työmenetelmiä. Opiskelija varmistaa tuntemattoman bakteerin identifikaation tekemällä DNA-sekvenssianalyysin bioinformatiikkaa hyödyntäen. Projektissa opiskelija oppii raportoimaan alalle sopivalle tieteellisellä tyylillä.

Sisältö

Bakteerien tunnistamiseen liittyvät keskeiset mikrobiologiset, biokemialliset ja molekyylibiologiset tutkimusmenetelmät: Erilaiset värjäys- ja viljelytekniikat, antibioottiherkkyyden määritys, entsyymireaktiot, lateksiagglutinaatio, elektroforeesit, PCR, sekvenssianalyysi. Mikrobien identifiointi MALDI TOF -MS -tekniikalla. Biologinen riskinarviointi ja raportointi.

Arviointiasteikko

0-5

Arviointikriteerit, tyydyttävä (1)

Opiskelija on osallistunut aktiivisesti projektityöhön. Projektityö valmistuu, ja tulokset raportoidaan.

Arviointikriteerit, hyvä (3)

Edellisen lisäksi opiskelija osaa
- laatia biologisen riskinarvioinnin ja toimia projektiryhmän vetäjänä tai aktiivisena jäsenenä sekä toteuttaa suunnitelmaa tavoitteellisesti
- työskennellä ryhmän mukana ja tarpeen mukaan organisoida työnsä uudelleen
- esittää ryhmänsä suunnitelmat ja tulokset sekä suullisesti että kirjallisesti.

Projekti on saavuttanut sille asetetut tavoitteet.

Arviointikriteerit, kiitettävä (5)

Edellisen lisäksi opiskelija
- osaa suunnitella laajahkon ja monipuolisen projektin, jossa on useita osatehtäviä
- valmistautuu projektityöhön perehtymällä monipuolisesti lähteisiin ja aikatauluttamalla työnsä etukäteen
Projektityö valmistuu ja tulokset raportoidaan suunnitellussa aikataulussa. Projekti on saavuttanut sille asetetut tavoitteet hyvin.

Esitietovaatimukset

Mikrobiologia ja ammatillinen englanti