Bakteerien identifiointiprojekti (5 op)
Toteutuksen tunnus: TX00FL64-3001
Toteutuksen perustiedot
- Ilmoittautumisaika
-
05.05.2025 - 31.05.2025
Ilmoittautuminen toteutukselle on käynnissä.
Ilmoittaudu toteutukselle OMAssa
- Ajoitus
-
20.10.2025 - 19.12.2025
Toteutus ei ole vielä alkanut.
- Opintopistemäärä
- 5 op
- Toteutustapa
- Lähiopetus
- Yksikkö
- (2019-2024) Puhtaat ja älykkäät ratkaisut
- Toimipiste
- Leiritie 1
- Opetuskielet
- suomi
- englanti
- Paikat
- 0 - 60
- Koulutus
- Degree Programme in Laboratory Science
- Opettajat
- Aki Ronkainen
- Tiina Soininen
- Ryhmät
-
TXV24S1Degree Programme in Laboratory Science, päivä
-
TXS24S1Laboratorioanalytiikan tutkinto-ohjelma päivä
-
TXSEXCHANGE2025_2NDLaboratoriotekniikan tutkinto-ohjelma: vaihto-opiskelijat 2. vuosi
- Opintojakso
- TX00FL64
Toteutuksella on 18 opetustapahtumaa joiden yhteenlaskettu kesto on 129 t 0 min.
| Aika | Aihe | Tila |
|---|---|---|
|
Ke 22.10.2025 klo 10:00 - 12:00 (2 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA238.2
Oppimistila
|
|
Ke 05.11.2025 klo 09:00 - 12:00 (3 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA238.2
Oppimistila
|
|
Ma 10.11.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Ti 11.11.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
To 13.11.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Pe 14.11.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Ma 17.11.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Ti 18.11.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Ke 19.11.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
To 20.11.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Pe 21.11.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Ma 24.11.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Ti 25.11.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Ke 26.11.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Ma 01.12.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Ti 02.12.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Ke 03.12.2025 klo 08:00 - 16:00 (8 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
|
Ke 10.12.2025 klo 08:00 - 12:00 (4 t 0 min) |
Bakteerien identifiointiprojekti TX00FL64-3001 |
MMA238.2
Oppimistila
|
Tavoitteet
Opintojaksossa opiskelija osallistuu biologisen riskinarvioinnin laatimiseen ja toimii projektiryhmän jäsenenä tuntemattoman bakteerin identifioimiseksi. Käytännön toteutusvaiheessa hän käyttää keskeisimpiä biokemiallisia, mikrobiologisia ja molekyylibiologisia työmenetelmiä. Opiskelija varmistaa tuntemattoman bakteerin identifikaation tekemällä DNA-sekvenssianalyysin bioinformatiikkaa hyödyntäen. Projektissa opiskelija oppii raportoimaan alalle sopivalle tieteellisellä tyylillä.
Sisältö
Bakteerien tunnistamiseen liittyvät keskeiset mikrobiologiset, biokemialliset ja molekyylibiologiset tutkimusmenetelmät: Erilaiset värjäys- ja viljelytekniikat, antibioottiherkkyyden määritys, entsyymireaktiot, lateksiagglutinaatio, elektroforeesit, PCR, sekvenssianalyysi. Mikrobien identifiointi MALDI TOF -MS -tekniikalla. Biologinen riskinarviointi ja raportointi.
Aika ja paikka
Leiritie 1, 2. periodi
Oppimateriaalit
Luennot ja erikseen annettavat laboratoriotyöohjeet
Opetusmenetelmät
Projekti- ja tiimityöskentely
Laboratoriotyöt
Mastering Microbiology
Harjoittelu- ja työelämäyhteistyö
FIMM (sekvensointi)
Tenttien ajankohdat ja uusintamahdollisuudet
Mastering Microbiology -tehtävien palautuspäivämäärät ilmoitetaan opintojakson alussa.
Kansainvälisyys
-
Toteutuksen valinnaiset suoritustavat
AHOT
Opiskelijan ajankäyttö ja kuormitus
Laboratoriopäivät ja seminaarit lukujärjestyksen mukaan.
Sisällön jaksotus
-
Lisätietoja opiskelijoille
KICK OFF -tilaisuus 2. periodin 1. opiskeluviikolla lukujärjestyksen mukaan
Arviointiasteikko
0-5
Arviointikriteerit, tyydyttävä (1)
Opiskelija on osallistunut aktiivisesti projektityöhön. Projektityö valmistuu, ja tulokset raportoidaan.
Arviointikriteerit, hyvä (3)
Edellisen lisäksi opiskelija osaa
- laatia biologisen riskinarvioinnin ja toimia projektiryhmän vetäjänä tai aktiivisena jäsenenä sekä toteuttaa suunnitelmaa tavoitteellisesti
- työskennellä ryhmän mukana ja tarpeen mukaan organisoida työnsä uudelleen
- esittää ryhmänsä suunnitelmat ja tulokset sekä suullisesti että kirjallisesti.
Projekti on saavuttanut sille asetetut tavoitteet.
Arviointikriteerit, kiitettävä (5)
Edellisen lisäksi opiskelija
- osaa suunnitella laajahkon ja monipuolisen projektin, jossa on useita osatehtäviä
- valmistautuu projektityöhön perehtymällä monipuolisesti lähteisiin ja aikatauluttamalla työnsä etukäteen
Projektityö valmistuu ja tulokset raportoidaan suunnitellussa aikataulussa. Projekti on saavuttanut sille asetetut tavoitteet hyvin.
Arviointimenetelmät ja arvioinnin perusteet
Laboratoriotyöskentelytaidot
Projektiraportti ja esitelmät
Mastering Microbiology ja muut opintotehtävät
Esitietovaatimukset
Mikrobiologia ja ammatillinen englanti