Bakteerien identifiointiprojekti (5 op)

Tavoitteet

Opintojaksossa opiskelija osallistuu biologisen riskinarvioinnin laatimiseen ja toimii projektiryhmän jäsenenä tuntemattoman bakteerin identifioimiseksi. Käytännön toteutusvaiheessa hän käyttää keskeisimpiä biokemiallisia, mikrobiologisia ja molekyylibiologisia työmenetelmiä. Opiskelija varmistaa tuntemattoman bakteerin identifikaation tekemällä DNA-sekvenssianalyysin bioinformatiikkaa hyödyntäen. Projektissa opiskelija oppii raportoimaan alalle sopivalle tieteellisellä tyylillä.

Sisältö

Bakteerien tunnistamiseen liittyvät keskeiset mikrobiologiset, biokemialliset ja molekyylibiologiset tutkimusmenetelmät: Erilaiset värjäys- ja viljelytekniikat, antibioottiherkkyyden määritys, entsyymireaktiot, lateksiagglutinaatio, elektroforeesit, PCR, sekvenssianalyysi. Mikrobien identifiointi MALDI TOF -MS -tekniikalla. Biologinen riskinarviointi ja raportointi.

Esitietovaatimukset

Mikrobiologia ja ammatillinen englanti

Työmuodot

Projekti- ja tiimityöskentely
Laboratoriotyöt
Mastering Microbiology

Aika ja paikka

Leiritie 1, 2. periodi

Oppimateriaali ja suositeltava kirjallisuus

Luennot ja erikseen annettavat laboratoriotyöohjeet

Opintojaksototeutuksen valinnaiset suoritustavat

AHOT

Harjoittelu- ja työelämäyhteistyö

FIMM (sekvensointi)

Tenttien ajankohdat ja uusintamahdollisuudet

Mastering Microbiology -tehtävien palautuspäivämäärät ilmoitetaan opintojakson alussa.

Kansainväliset yhteydet

-

Opiskelijan ajankäyttö ja kuormitus

Laboratoriopäivät ja seminaarit lukujärjestyksen mukaan.

Sisällön jaksotus

-

Lisätietoja opiskelijoille

KICK OFF -tilaisuus 2. periodin 1. opiskeluviikolla lukujärjestyksen mukaan

Arviointimenetelmät ja arvioinnin perusteet

Laboratoriotyöskentelytaidot
Projektiraportti ja esitelmät
Mastering Microbiology ja muut opintotehtävät

Arviointiasteikko

0-5

Arviointikriteerit arvosanalle 1 tyydyttävä

Opiskelija on osallistunut aktiivisesti projektityöhön. Projektityö valmistuu, ja tulokset raportoidaan.

Arviointikriteerit arvosanalle 3 hyvä

Edellisen lisäksi opiskelija osaa
- laatia biologisen riskinarvioinnin ja toimia projektiryhmän vetäjänä tai aktiivisena jäsenenä sekä toteuttaa suunnitelmaa tavoitteellisesti
- työskennellä ryhmän mukana ja tarpeen mukaan organisoida työnsä uudelleen
- esittää ryhmänsä suunnitelmat ja tulokset sekä suullisesti että kirjallisesti.

Projekti on saavuttanut sille asetetut tavoitteet.

Arviointikriteerit arvosanalle 5 kiitettävä

Edellisen lisäksi opiskelija
- osaa suunnitella laajahkon ja monipuolisen projektin, jossa on useita osatehtäviä
- valmistautuu projektityöhön perehtymällä monipuolisesti lähteisiin ja aikatauluttamalla työnsä etukäteen
Projektityö valmistuu ja tulokset raportoidaan suunnitellussa aikataulussa. Projekti on saavuttanut sille asetetut tavoitteet hyvin.