Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet (5 op)
Toteutuksen tunnus: TX00FO52-3001
Toteutuksen perustiedot
- Ilmoittautumisaika
-
01.05.2024 - 31.05.2024
Ilmoittautuminen toteutukselle on päättynyt.
- Ajoitus
-
19.08.2024 - 11.10.2024
Toteutus on päättynyt.
- Opintopistemäärä
- 5 op
- Lähiosuus
- 5 op
- Toteutustapa
- Lähiopetus
- Yksikkö
- (2019-2024) Puhtaat ja älykkäät ratkaisut
- Toimipiste
- Leiritie 1
- Opetuskielet
- suomi
- englanti
- Paikat
- 0 - 40
- Koulutus
- Bio- ja kemiantekniikan tutkinto-ohjelma
Toteutuksella on 15 opetustapahtumaa joiden yhteenlaskettu kesto on 50 t 0 min.
Aika | Aihe | Tila |
---|---|---|
Ke 21.08.2024 klo 08:00 - 11:00 (3 t 0 min) |
Geenitekniikka TX00EA27-3004, Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMA101
A-auditorio
|
To 22.08.2024 klo 08:00 - 11:00 (3 t 0 min) |
Geenitekniikka TX00EA27-3004, Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMC364
Oppimistila
|
Ke 28.08.2024 klo 08:00 - 11:00 (3 t 0 min) |
Geenitekniikka TX00EA27-3004, Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMB301
Auditorio 3 krs.
|
To 29.08.2024 klo 14:00 - 17:00 (3 t 0 min) |
Geenitekniikka TX00EA27-3004, Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001, Guest+ lecture |
MMC364
Oppimistila
|
Ke 04.09.2024 klo 14:00 - 17:00 (3 t 0 min) |
Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMB249
IT-Tila
|
Ma 23.09.2024 klo 14:00 - 17:00 (3 t 0 min) |
Geenitekniikka TX00EA27-3004, Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMB301
Auditorio 3 krs.
|
Ti 24.09.2024 klo 12:00 - 15:00 (3 t 0 min) |
Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMB249
IT-Tila
|
To 26.09.2024 klo 08:00 - 12:00 (4 t 0 min) |
Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
Pe 27.09.2024 klo 13:00 - 17:00 (4 t 0 min) |
Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
MMA252 Mikrobiologian laboratorio 2 MMA251 Mikrobiologian laboratorio 1 |
Ma 30.09.2024 klo 09:00 - 12:00 (3 t 0 min) |
Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
MMA252 Mikrobiologian laboratorio 2 |
Ti 01.10.2024 klo 12:00 - 16:00 (4 t 0 min) |
Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
Ke 02.10.2024 klo 08:00 - 12:00 (4 t 0 min) |
Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
Ke 02.10.2024 klo 14:00 - 17:00 (3 t 0 min) |
Geenitekniikka TX00EA27-3004, Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMC230
Oppimistila
|
Pe 04.10.2024 klo 12:00 - 16:00 (4 t 0 min) |
Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 |
MMA247
Biokemian laboratorio
|
Ke 09.10.2024 klo 14:00 - 17:00 (3 t 0 min) |
Geenitekniikka TX00EA27-3004, Geenitekniikka ja bioinformatiikan perusteet TX00FO52-3001 EXAM |
MMC230
Oppimistila
|
Tavoitteet
Opiskelija hallitsee geenitekniikan perustekniikat teorian ja käytännön tasolla. Opiskelija ymmärtää DNA-analyysien merkityksen eri sovelluksissa, esimerkiksi kloonauksen, yksilöntunnistuksen tai GMO-analyysin yhteydessä. Opiskelija on tutustunut geenitekniikan lainsäädäntöön, ja pohtinut alaan liittyviä eettisiä kysymyksiä. Opiskelija osaa bioinformatiikan perusteita.
Sisältö
Kloonauksen perusmenetelmät. DNA:n monistus- ja sekvensointitekniikat, DNA-bioinformatiikan perusteet, RNAi-mekanismit sekä genomin muokkaus.
Geenitekniikan etiikka, geenitekniikkalainsäädäntö ja riskianalyysit.
Opiskelija eristää, puhdistaa ja karakterisoi nukleiinihappoja käytännön laboratoriotöissä.
Aika ja paikka
Leiritie 1, 1. periodi
Oppimateriaalit
Suominen Ilari, Pärssinen Raimo, Haajanen Kari & Pelkonen Jani.
Geenitekniikka ja/tai
Pärssinen, R., Suominen, I. & Haajanen, K. Biogeeni. Ammatillista biokemiaa ja geenitekniikkaa.
Räikkä, J. ja Rossi, K. Geenit ja etiikka.
Muu tunnilla jaettu materiaali.
Opetusmenetelmät
Aktivoiva luento
Laboratorioharjoitukset
Pienryhmäohjaus
Bioinformatiikan opetusohjelmat
Harjoittelu- ja työelämäyhteistyö
FIMM, NGS sekvensointiluento
VTT, Applications of genetic engineering
Tenttien ajankohdat ja uusintamahdollisuudet
Ilmoitetaan kurssin alussa.
Toteutuksen valinnaiset suoritustavat
AHOT
Opiskelijan ajankäyttö ja kuormitus
Luennot lukujärjestyksen mukaan ja laboratoriotyöt toteutetaan.
Arviointiasteikko
0-5
Arviointikriteerit, tyydyttävä (1)
Opiskelija osoittaa ymmärtävänsä geenitekniikan periaatteet.
Opiskelijalla tarvitsee laajamittaista ohjausta perustekniikoiden suorittamisessa.
Opiskelijalla on vaikeuksia analysoida kokeellisia tietoja eikä hän välttämättä osaa sovelltaa tietoa kriittisesti.
Opiskelijalla on perustiedot bioinformatiikan käsitteistä.
Opiskelijalla ei hallitse bioinformatiikan välineitä ja ohjelmistoja.
Arviointikriteerit, hyvä (3)
Opiskelija osoittaa ymmärtävänsä hyvin geenitekniikan periaatteet, mukaan lukien sellaiset käsitteet kuin geenien kloonaus.
Opiskelija osoittaa hyvää käytännön osaamista geenitekniikan tekniikoissa, kuten DNA:n eristäminen, PCR:ssä ja geelielektroforeesissa, vähäisellä ohjauksella.
Opiskelija analysoi kokeellisia tietoja, tekee loogisia johtopäätöksiä ja soveltaa kriittisen ajattelun taitoja tieteellisten kysymysten ja haasteiden ratkaisemiseen.
Opiskelija ymmärtää hyvin bioinformatiikan periaatteet, mukaan lukien sekvenssianalyysi, tietokannat ja laskennalliset työkalut. Opiskelija osaa käyttää tavanomaisia bioinformatiikan työkaluja ja ohjelmistoja esimerkiksi sekvenssien kohdistamiseen, tiedonhakuun ja tietojen analysointiin.
Arviointikriteerit, kiitettävä (5)
Opiskelija ymmärtää erinomaisesti geenitekniikan periaatteet ja osaa selittää monimutkaisia tekniikoita ja niiden sovelluksia.
Opiskelija osoittaa erinomaista käytännön osaamista, suorittaa itsenäisesti geeniteknologian työmenetelmiä ja huomioi mahdolliset virhelähteet.
Opiskelija osoittaa erinomaisia analyyttisiä ja kriittisiä ajattelutaitoja.
Opiskelija osoittaa ymmärtävänsä erinomaisesti bioinformatiikan perusteita ja kykenee selittämään käsitteitä ja niiden merkitystä genomiikan ja molekyylibiologian kannalta.
Opiskelija osoittaa erinomaista taitoa käyttää bioinformatiikan välineitä ja ohjelmistoja, mukaan lukien tiedonlouhinta ja geneettinen analyysi.
Opiskelija ymmärtää erinomaisesti geenitekniikan periaatteet ja osaa selittää monimutkaisia tekniikoita ja niiden sovelluksia.
Opiskelija osoittaa erinomaista käytännön osaamista, suorittaa itsenäisesti kehittyneitä geeniteknologian kokeita ja etsii tarvittaessa vikoja.
Opiskelija osoittaa erinomaisia analyyttisiä ja kriittisiä ajattelutaitoja ja tarjoaa innovatiivisia ratkaisuja ja näkemyksiä geeniteknologian alalla.
Opiskelija osoittaa ymmärtävänsä erinomaisesti bioinformatiikkaa ja kykenee selittämään kehittyneitä käsitteitä ja niiden merkitystä genomiikan ja molekyylibiologian kannalta.
Opiskelija osoittaa poikkeuksellista taitoa käyttää monenlaisia bioinformatiikan välineitä ja ohjelmistoja, mukaan lukien monimutkainen tiedonlouhinta ja -analyysi.
Opiskelija osaa erinomaisestii yhdistää geenitekniikan tuloksia ja bioinformatiikan työkaluja tuosten analysoinnissa.
Arviointikriteeri, hyväksytty/hylätty
Opiskelija osoittaa ymmärtävänsä geenitekniikan periaatteet.
Opiskelijalla tarvitsee laajamittaista ohjausta perustekniikoiden suorittamisessa.
Opiskelijalla on vaikeuksia analysoida kokeellisia tietoja eikä hän välttämättä osaa sovelltaa tietoa kriittisesti.
Opiskelijalla on perustiedot bioinformatiikan käsitteistä.
Opiskelijalla ei hallitse bioinformatiikan välineitä ja ohjelmistoja.
Arviointimenetelmät ja arvioinnin perusteet
Tentti, opintotehtävät ja laboratorio raportti
Esitietovaatimukset
Mikrobien maailmaa