Kliinisen mikrobiologian tutkimukset (10 op)

Tavoitteet

Opiskelija
- tekee ja tulkitsee perustellen mikrobitunnistustestit yleisimmin käytetyillä määritysmenetelmillä kliinisen bakteriologian, mykologian, parasitologian ja virologian laboratorioissa
-selittää, miten infektioidenvastainen organisaatio toimii Suomessa ja minkälainen lainsäädäntö toimilupamenettelyineen ohjaa mikrobiologista laboratoriotoimintaa

Sisältö

Yleinen mikrobiologia: Kliinisen mikrobiologian tehtävät yhteiskunnassa, infektioepidemiologia ja infektioiden torjunnan vastainen organisaatio Suomessa. Tartuntatautilainsäädäntö ja mikrobiologisen laboratoriotoiminnan luvanvaraisuus ja ilmoitusvelvollisuus löydöksistä. Keskeiset infektiosairaudet laboratoriotoiminnan kannalta sekä mikrobitautien ehkäisy rokottamalla.
Kliininen bakteriologia: Kliinisen mikrobiologian näytteenoton tiedolliset perusteet, kliinisesti tärkeimpien aerobibakteereiden laboratoriodiagnostiikka, bakteerigenetiikan määritysmenetelmät, antibioottiherkkyyden määrittäminen, sairaalainfektioita aiheuttavat bakteerilajit.
Kliininen parasitologia: Parasitologisten näytteiden oton perusteet, suomalaisissa laboratorioissa esiintyvien yleisimpien parasiittien laboratoriotutkimusmenetelmät, ulosteen ja veren parasiittien tunnistus.
Kliininen mykologia: Sieninäytteenoton perusteet, sienten viljely kasvatusalustoille, hiiva- ja rihmasienten laboratoriodiagnostiikka, antimykoottiset lääkeainetutkimukset hiivasienillä.
Kliininen virologia ja infektioimmunologia: Infektioimmunologian ja autoimmuunisairauksien keskeiset laboratoriotutkimukset, virologisten näytteiden otto, käsittely ja kuljetus. Soluviljelyistä virusviljelmiin, molekyyligenetiikan menetelmät virologiassa, vasta-ainetutkimukset, antigeenien osoitusmenetelmät, fluoresenssin hyödyntäminen tutkimusmenetelmissä.

Esitietovaatimukset

Edeltävät opinnot:
Anatomia, fysiologia ja patofysiologia, Laboratoriotyön menetelmien perusteet, Kemia, Fysiikka ja Matematiikka, Immunologia, Solubiologia, solumorfologia ja sytologia sekä Kliinisen biokemian tutkimukset

Työmuodot

Aktivoivat teorialuennot Zoom-yhteydellä. Kaikkia luentoja ei tallenneta. Tallennetut luennot ovat kuunneltavissa kaksi viikkoa.
Erilaiset Moodlessa olevat ryhmä- ja yksilötehtävät.
Laboraatiot
Oppimispäiväkirjat

Opettajan laatimat tehtävät ja MATERIAALIT ovat Tekijänoikeuslain (404/61) mukaisia teoksia, joihin opettajalla on tekijänoikeus. Tehtäviä JA MATERIAALEJA ei saa käyttää muuten kuin omissa opinnoissaan. Niiden julkinen levittäminen on sallittua vain opettajan luvalla.

Aika ja paikka

Opintojakso alkaa 21.10 pakollisella orientaatiolla. Osa opintojakson laboraatioista suoritetaan keväällä 2021.

Oppimateriaali ja suositeltava kirjallisuus

Soveltuvin osin
Mikrobiologia; mikrobiologia, immunologia ja infektiosairaudet kirjat 1 ja 2. Duodecim. Hedman, Heikkinen, Huovinen, Järvinen, Meri, Vaara.
Hoitoon liittyvien infektioiden torjunta 2010 tai uudempi. Anttila ym.
Annetut artikkelit
Moodle materiaali
Muu ilmoitettu materiaali

Opintojaksototeutuksen valinnaiset suoritustavat

-

Harjoittelu- ja työelämäyhteistyö

Lopputentti ja tehtävät tulee olla suoritettu hyväksytysti ennen työelämäharjoittelujaksoa.

Tenttien ajankohdat ja uusintamahdollisuudet

Tentti XXXXXXX
Uusinnat: XXXXXXXX Muita uusintoja ei ole. Täydentyy myöhemmin.

Kansainväliset yhteydet

-

Opiskelijan ajankäyttö ja kuormitus

Opintojakso 10op = 270h
Teoriaopetus, laboraatiot
Itsenäinen työskentely

Sisällön jaksotus

Opintojakso alkaa pakollisella orientaatiolla 21.10.20 Läsnäololla varmistetaan paikka opintojaksolla. Jälki-ilmoittautumisia ei huomioida.

Opintojakso sisältää kliinistä bakteriologiaa, virologiaa, parasitologiaa ja mykologiaa.

Lisätietoja opiskelijoille

Opintojakson opettajat
Kirsi-Marja Kartastenpää-Wihlman Laboraatiot (vastuuopettaja)
Heini Kutvonen bakteriologian teoria opetus
Merja Ojala virologian, mykologian ja parasitologian opetus

Opintojaksolle ilmoittautuminen ilmoittautumisaikana. Jälki-ilmoittautumisia ei huomioida.
Opintojakso sisältää pakollisia teoriatunteja. Merkitty lukujärjestykseen.

Laboraatiot ovat pakollisia. Laboraatioissa asianmukainen vaatetus.
Opiskelija valmistautuu laboraatio opetukseen etukäteismateriaalien avulla. Materiaalin tehtävät palautetaan sovittuna aikana ennen laboraatioita moodleen. On edellytys laboraatiohin osallistumiseen.
Työkoe. Työkokeeseen osallistuminen edellyttää, että kaikki laboraatiot on suoritettu ja laboraatiopäiväkirjat on palautettu ennen työkoetta annettuihin päivämääriin mennessä.

Lisäinformaatiot Moodle työtilassa. Työtilan avaimen saa orientaatio luennolla.
Muutokset lukujärjestyksessä mahdollisia.
Ilmoittautumisten hyväksymisen periaatteet
- ensin hyväksytään ne opiskelijat, jotka kuuluvat siihen ryhmään, jolle toteutus on suunnattu
- toiseksi hyväksytään nopeuttajat, mikäli opintojaksolla on paikkoja
- mahdolliset muut hyväksymismenettelytavat.
Mikäli suorituksia/tehtäviä ei ole tehty 2. uusintatenttipäivämäärään mennessä, toteutus arvioidaan hylätyksi ja opiskelijan on ilmoittauduttava uudelle toteutukselle.
Pääsääntöisesti puuttuva(t) laboraatio(t) korvataan seuraavan sovitun toteutuksen yhteydessä.

Palauttamalla verkkotentin tai verkkototeutuksen tehtävät opiskelija vakuuttaa osaamisen osoittamisensa perustuvan itsenäiseen tekemiseen ja eettiseen toimintaan. Vilppi voi johtaa jopa vuoden määräaikaiseen erottamiseen ammattikorkeakoulusta. Ammattikorkeakoululaki 932/2014, 38 §. Verkkototeutuksen itsenäisen osaamisen varmistamiseksi opettaja voi harkintansa mukaan edellyttää osaamisen osoittamista valvotuissa olosuhteissa tai suullisella tentillä.

Arviointimenetelmät ja arvioinnin perusteet

Bakteriologian, mykologian,parasitologian ja virologian osa-alueet kokoava lopputentti (Arviointi 1-5) sekä pisteytetyt tehtävät. Mahdolliset tehtävistä saadut pisteet sisällytetyttään lopputenttiin.
Arviointikehikko/arvioinnit/pisteytykset käydään läpi orientaatio tunnilla.
Työkoe (hyväksytty/hylätty)
Moodle- ja muut tehtävät
Formatiivinen arviointi.
Opintojakson arvosanaa mahdollista korottaa toteutuksella mainittujen uusintatenttien yhteydessä.
Korottaminen koskee koko opintojakson arvosanaa ja se voidaan toteuttaa vain kerran uusintatenttien antamissa puitteissa.

Arviointiasteikko

0-5

Arviointikriteerit arvosanalle 1 tyydyttävä

Arviointikriteerit ks. liite.
Osaamisen arvioinnissa käytetään arviointikriteereiden tasoa aloittelija, edistynyt tai asiantuntija.

Arviointikriteerit arvosanalle hyväksytty

Hyväksytty – hylätty. Katso arviointikehikko (erillinen liite)