Skip to main content

Bacterial Identification ProjectLaajuus (5 cr)

Code: TX00EA28

Credits

5 op

Objective

In these studies the student acts a member of the project group and takes part in making the research plan to identify microbes. During the practical work he/she uses the most important biochemical, microbiological and molecular biological research techniques. The student learns how to report in a scientific way.

Content

The most important research methods in microbiology and biochemistry that are related to the identification of microbes in practice (Different staining and culturing techniques; Determination of antibiotic resistance, enzyme reactions, latex agglutination and protein concentration; Electrophoresis; PCR, sequence analysis). Project plan and reporting.

Prerequisites

Microbiology and Professional English
The Basics of Biosciences

Assessment criteria, satisfactory (1)

The student has worked actively in the project. The project has been completed and the results have been reported.

Assessment criteria, good (3)

In addition the the above, the student is also able to:
- write project plans and act either as a project group leader or as an active member and be goal-driven when implementing the project plan
- work in the group and if necessary organize the work differently
- present project plans and results orally and in writing to stakeholders
The project has achieved the set goals.

Assessment criteria, excellent (5)

The student is also able to:
- plan a quite wide and diverse project, which includes many tasks
- familiarize him/herself beforehand with diverse sources and make a time schedule
The project is completed and the results are reported in time. The project has achieved the set goals well.

Assessment criteria, approved/failed

The student has worked actively in the project. The project has been completed and the results have been reported.

Enrollment

01.05.2024 - 31.05.2025

Timing

19.08.2024 - 11.10.2024

Number of ECTS credits allocated

5 op

Mode of delivery

Contact teaching

Unit

School of Smart and Clean Solutions

Campus

Leiritie 1

Teaching languages
  • Finnish
Seats

0 - 40

Degree programmes
  • Laboratory Sciences
Teachers
  • Hye Jung-Majanen
  • Tiina Soininen
Groups
  • TXS23S1
    Laboratorioanalytiikan tutkinto-ohjelma päivä

Objective

Opintokokonaisuudessa opiskelija toimii projektiryhmän jäsenenä ja osallistuu projektisuunnitelman laatimiseen tuntemattoman bakteerin identifioimiseksi. Käytännön toteutusvaiheessa hän käyttää keskeisimpiä biokemiallisia, mikrobiologisia ja molekyylibiologisia työmenetelmiä. Projektissa opiskelija oppii raportoimaan alalle sopivalle tieteellisellä tyylillä.

Content

Bakteerien tunnistamiseen liittyvät keskeiset mikrobiologiset ja biokemialliset tutkimusmenetelmät käytännössä: Erilaiset värjäys- ja viljelytekniikat, antibioottiherkkyyden määritys, entsyymireaktiot, lateksiagglutinaatio, proteiinipitoisuusmääritykset, elektroforeesit, PCR, sekvenssianalyysi. Projektisuunnitelman teko ja raportointi.

Location and time

Leiritie 1, 1. periodi

Materials

Luennot ja erikseen annettavat laboratoriotyöohjeet

Teaching methods

Projekti- ja tiimityöskentely
Laboratoriotyöt
Mastering Microbiology

Employer connections

FIMM (sekvensointi)

Exam schedules

Mastering Microbiology -tehtävät

International connections

-

Completion alternatives

AHOT

Student workload

Laboratoriopäivät ja seminaarit lukujärjestyksen mukaan.

Content scheduling

-

Further information

KICK OFF -tilaisuus 1. opiskeluviikolla lukujärjestyksen mukaan

Evaluation scale

0-5

Assessment criteria, satisfactory (1)

Opiskelija on osallistunut aktiivisesti projektityöhön. Projektityö valmistuu, ja tulokset raportoidaan.

Assessment criteria, good (3)

Edellisen lisäksi opiskelija osaa
- laatia projektisuunnitelmia ja toimia projektiryhmän vetäjänä tai aktiivisena jäsenenä sekä toteuttaa suunnitelmaa tavoitteellisesti
- työskennellä ryhmän mukana ja tarpeen mukaan organisoida työnsä uudelleen
- esittää ryhmänsä suunnitelmat ja tulokset sidosryhmille sekä suullisesti että kirjallisesti.
Projekti on saavuttanut sille asetetut tavoitteet.

Assessment criteria, excellent (5)

Edellisen lisäksi opiskelija
- osaa suunnitella laajahkon ja monipuolisen projektin, jossa on useita osatehtäviä
- valmistautuu projektityöhön perehtymällä monipuolisesti lähteisiin ja aikatauluttamalla työnsä etukäteen
Projektityö valmistuu ja tulokset raportoidaan suunnitellussa aikataulussa. Projekti on saavuttanut sille asetetut tavoitteet hyvin.

Assessment criteria, approved/failed

Opiskelija on osallistunut aktiivisesti projektityöhön. Projektityö valmistuu, ja tulokset raportoidaan.

Assessment methods and criteria

Laboratoriotyöskentelytaidot
Projektiraportti ja esitelmä
Mastering Microbiology ja muut opintotehtävät

Prerequisites

Mikrobiologia ja ammatillinen englanti
Biotieteiden perusteet

Enrollment

01.05.2023 - 31.05.2023

Timing

21.08.2023 - 13.10.2023

Number of ECTS credits allocated

5 op

Mode of delivery

Contact teaching

Unit

School of Smart and Clean Solutions

Campus

Leiritie 1

Teaching languages
  • Finnish
Seats

0 - 40

Degree programmes
  • Laboratory Sciences
Teachers
  • Patrik Paxal
  • Hye Jung-Majanen
  • Tiina Soininen
Teacher in charge

Liisa Heikkilä

Groups
  • TXS22S1
    Laboratorioanalytiikan tutkinto-ohjelma päivä

Objective

Opintokokonaisuudessa opiskelija toimii projektiryhmän jäsenenä ja osallistuu projektisuunnitelman laatimiseen tuntemattoman bakteerin identifioimiseksi. Käytännön toteutusvaiheessa hän käyttää keskeisimpiä biokemiallisia, mikrobiologisia ja molekyylibiologisia työmenetelmiä. Projektissa opiskelija oppii raportoimaan alalle sopivalle tieteellisellä tyylillä.

Content

Bakteerien tunnistamiseen liittyvät keskeiset mikrobiologiset ja biokemialliset tutkimusmenetelmät käytännössä: Erilaiset värjäys- ja viljelytekniikat, antibioottiherkkyyden määritys, entsyymireaktiot, lateksiagglutinaatio, proteiinipitoisuusmääritykset, elektroforeesit, PCR, sekvenssianalyysi. Projektisuunnitelman teko ja raportointi.

Location and time

Leiritie 1, 1. periodi

Materials

Luennot ja erikseen annettavat laboratoriotyöohjeet

Teaching methods

Projekti- ja tiimityöskentely
Laboratoriotyöt
Mastering Microbiology

Employer connections

FIMM (sekvensointi)

Exam schedules

Mastering Microbiology -tehtävät

International connections

-

Completion alternatives

AHOT

Student workload

Laboratoriopäivät ja seminaarit lukujärjestyksen mukaan.

Content scheduling

-

Further information

KICK OFF -tilaisuus 1. opiskeluviikolla lukujärjestyksen mukaan

Evaluation scale

0-5

Assessment criteria, satisfactory (1)

Opiskelija on osallistunut aktiivisesti projektityöhön. Projektityö valmistuu, ja tulokset raportoidaan.

Assessment criteria, good (3)

Edellisen lisäksi opiskelija osaa
- laatia projektisuunnitelmia ja toimia projektiryhmän vetäjänä tai aktiivisena jäsenenä sekä toteuttaa suunnitelmaa tavoitteellisesti
- työskennellä ryhmän mukana ja tarpeen mukaan organisoida työnsä uudelleen
- esittää ryhmänsä suunnitelmat ja tulokset sidosryhmille sekä suullisesti että kirjallisesti.
Projekti on saavuttanut sille asetetut tavoitteet.

Assessment criteria, excellent (5)

Edellisen lisäksi opiskelija
- osaa suunnitella laajahkon ja monipuolisen projektin, jossa on useita osatehtäviä
- valmistautuu projektityöhön perehtymällä monipuolisesti lähteisiin ja aikatauluttamalla työnsä etukäteen
Projektityö valmistuu ja tulokset raportoidaan suunnitellussa aikataulussa. Projekti on saavuttanut sille asetetut tavoitteet hyvin.

Assessment criteria, approved/failed

Opiskelija on osallistunut aktiivisesti projektityöhön. Projektityö valmistuu, ja tulokset raportoidaan.

Assessment methods and criteria

Laboratoriotyöskentelytaidot
Projektiraportti ja esitelmä
Mastering Microbiology ja muut opintotehtävät

Prerequisites

Mikrobiologia ja ammatillinen englanti
Biotieteiden perusteet

Enrollment

02.05.2022 - 12.06.2022

Timing

22.08.2022 - 14.10.2022

Number of ECTS credits allocated

5 op

Mode of delivery

Contact teaching

Unit

School of Smart and Clean Solutions

Campus

Leiritie 1

Teaching languages
  • Finnish
Seats

0 - 40

Degree programmes
  • Laboratory Sciences
Teachers
  • Jarmo Palm
  • Tiina Soininen
Groups
  • TXS21S1
    Laboratorioanalytiikan tutkinto-ohjelma päivä

Objective

Opintokokonaisuudessa opiskelija toimii projektiryhmän jäsenenä ja osallistuu projektisuunnitelman laatimiseen tuntemattoman bakteerin identifioimiseksi. Käytännön toteutusvaiheessa hän käyttää keskeisimpiä biokemiallisia, mikrobiologisia ja molekyylibiologisia työmenetelmiä. Projektissa opiskelija oppii raportoimaan alalle sopivalle tieteellisellä tyylillä.

Content

Bakteerien tunnistamiseen liittyvät keskeiset mikrobiologiset ja biokemialliset tutkimusmenetelmät käytännössä: Erilaiset värjäys- ja viljelytekniikat, antibioottiherkkyyden määritys, entsyymireaktiot, lateksiagglutinaatio, proteiinipitoisuusmääritykset, elektroforeesit, PCR, sekvenssianalyysi. Projektisuunnitelman teko ja raportointi.

Location and time

Leiritie 1, 1. periodi

Materials

Luennot ja erikseen annettavat laboratoriotyöohjeet

Teaching methods

Projekti- ja tiimityöskentely
Laboratoriotyöt
Mastering Microbiology

Employer connections

FIMM (sekvensointi)

Exam schedules

Mastering Microbiology -tehtävät

International connections

-

Completion alternatives

AHOT

Student workload

Laboratoriopäivät ja seminaarit lukujärjestyksen mukaan.

Content scheduling

-

Further information

KICK OFF -tilaisuus 1. opiskeluviikolla lukujärjestyksen mukaan

Evaluation scale

0-5

Assessment criteria, satisfactory (1)

Opiskelija on osallistunut aktiivisesti projektityöhön. Projektityö valmistuu, ja tulokset raportoidaan.

Assessment criteria, good (3)

Edellisen lisäksi opiskelija osaa
- laatia projektisuunnitelmia ja toimia projektiryhmän vetäjänä tai aktiivisena jäsenenä sekä toteuttaa suunnitelmaa tavoitteellisesti
- työskennellä ryhmän mukana ja tarpeen mukaan organisoida työnsä uudelleen
- esittää ryhmänsä suunnitelmat ja tulokset sidosryhmille sekä suullisesti että kirjallisesti.
Projekti on saavuttanut sille asetetut tavoitteet.

Assessment criteria, excellent (5)

Edellisen lisäksi opiskelija
- osaa suunnitella laajahkon ja monipuolisen projektin, jossa on useita osatehtäviä
- valmistautuu projektityöhön perehtymällä monipuolisesti lähteisiin ja aikatauluttamalla työnsä etukäteen
Projektityö valmistuu ja tulokset raportoidaan suunnitellussa aikataulussa. Projekti on saavuttanut sille asetetut tavoitteet hyvin.

Assessment criteria, approved/failed

Opiskelija on osallistunut aktiivisesti projektityöhön. Projektityö valmistuu, ja tulokset raportoidaan.

Assessment methods and criteria

Laboratoriotyöskentelytaidot
Projektisuunnitelma
Projektiraportti ja esitelmä
Mastering Microbiology ja muut opintotehtävät

Prerequisites

Mikrobiologia ja ammatillinen englanti
Biotieteiden perusteet