Mikroskopia ja kuvankäsittelyLaajuus (3 op)

Osaamistavoitteet

Opiskelija osaa optiikan perusteet mikroskopian näkökulmasta. Opiskelija perehtyy erilaisiin mikroskopiatekniikoihin, mikroskopianäytteiden valmistamiseen ja mikroskoopin ylläpitoon. Opiskelija osaa käsitellä ja analysoida mikroskooppikuvia sekä muiden laboratorioanalyysien visuaalisia tuloksia

Sisältö

1. Optiikan perusteet mikroskopian näkökulmasta
2. Valomikroskopia: laitteiston rakenne, toiminta ja ylläpito. Fluoresenssimikroskopia, konfokaalimikroskopia ja elektronimikroskopia
3. Erilaisten mikroskopianäytteiden valmistus
4. Mikroskopiassa ja muussa laboratorioanalytiikassa tavattavien digitaalisten kuvien määrälliset analyysit ja visualisoint

Esitietovaatimukset

TX00AD19 Biomolekyylit

Arviointikriteerit, tyydyttävä (1)

1. Opiskelija osaa optiikan perusteet.
2. Opiskelija tuntee valomikroskopian toimintaperiaatteen.
3. Opiskelija osaa valmistaa erilaisia mikroskopianäytteitä.
4. Opiskelija osaa käyttää kuvankäsittelyohjelman perustoimintoja, sekä ymmärtää digitaalikuvan rakenteen

Arviointikriteerit, hyvä (3)

1. Opiskelija osaa optiikan perusteet ja ymmärtää optiikan merkityksen kuvan muodostumisessa ja resoluutiossa.
2. Opiskelija tuntee erilaisten mikroskopiatekniikoiden periaatteita.
3. Opiskelija osaa valmistaa erilaisia mikroskopianäytteitä ja osaa arvioida näytteenkäsittelyn onnistumista. Opiskelija osaa valita kullekin näytteelle sopivan mikroskooppitekniikan.
4. Opiskelija pystyy mittaamaan kuvassa esiintyviä suureita, kuten esimerkiksi kirkkausasteita, kokoa ja partikkeleiden määrää, sekä osaa tallentaa digitaaliset kuvatiedostot julkaisuja ja esityksiä varten oikeassa tiedostoformaatissa, riittävällä resoluutiolla ja riittävän oheisinformaation kera.

Arviointikriteerit, kiitettävä (5)

1. Opiskelija osaa optiikan perusteet niin, että hän osaa selittää erilaisten laitteistojen toimintaa optiikan näkökulmasta. Lisäksi opiskelija osaa käyttää ja soveltaa optiikan ymmärrystään mikroskoopin tai sen osien hankintaprosessin yhteydessä.
2. Opiskelija osaa selittää erilaisten mikroskopiatekniikoiden periaatteita ja vertailla tekniikoita keskenään.
3. Opiskelija osaa valmistaa erilaisia mikroskopianäytteitä ja osaa arvioida näytteenkäsittelyn onnistumista ja tuloksen luotettavuutta. Opiskelija osaa valita kullekin näytteelle oikean mikroskooppitekniikan ja osaa ehdottaa vaihtoehtoisia menetelmiä näytteenkäsittelyssä.
4. Opiskelija pystyy suorittamaan vertailevia analyysejä digitaalikuvista numeerisesti, sekä ymmärtää vertailevassa kuva-analyysissä vaadittavan kalibroinnin merkityksen. Opiskelija osaa visualisoida kuvista keskeisen informaation esityksiä ja julkaisuja varten muokkaamatta kuvan sisältämää informaatiota keinotekoisesti.